Jusqu'en 1981, l'essentiel de mes activités de recherche est en
analyse de données, et me permet de développer une compétence forte sur le
modèle linéaire.
Cette recherche débouche sur ma
thèse
en 1981 et sur plusieurs articles : sur les
ordres entre formes quadratiques,
l'optimalité en analyse factorielle
partie 1 et
partie 2,
l'analyse multicanonique ainsi que sur plusieurs communications :
décomposition des formes quadratiques,
optimalité en analyse en composantes principales,
optimisation en analyse de données.
Ces articles et communications sont relatifs
d'une part aux propriétés d'optimalité des sous espaces propres en
ACP, d'autre part aux généralisations de l'analyse canonique à plus de
deux groupes de variables.
Pendant la même période, je développe une compétence forte sur le modèle
linéaire. Assez naturellement, après avoir écrit la
notice du programme ANAV3 d'analyse de variance orthogonale écrit par
J. Arnoux (qui dirigait à cette époque le laboratoire de Biométrie et
Calcul automatique), je développe des modules de calcul pour traiter le
cas non orthogonal, cas qui se présente souvent dans les applications.
Ces modules aboutiront en 1978 à la création du programme MODLI, écrit
en Fortan, qui peut
traiter à l'époque des modèles linéaires comportant plus de 300
paramètres sur notre MITRA15 dont la mémoire centrale avait seulement
16000 mots de 32 bits en mémoire centrale. En 1985, une extension
importante pour les calculs de moyennes et contrastes est rajoutée à
MODLI. Cette extension n'a pas d'équivalent à ce jour dans
les autres programmes
connus de traitement du modèle linéaire et est un point de départ de
tous mes travaux sur la reparamétrisation dans le modèle linéaire :
tactiques en analyse de variance et de régression,
les plans factoriels,
reparamétrisation pertinentes dans les plans factoriels
non uniformes.
A partir de 1982, je me consacre essentiellement à la recherche
sur les constructions de plans d'expériences. Ce domaine, à l'évidence
fondamental pour les recherches menées à l'INRA, est totalement négligé
par la statistique française. Le recrutement ultérieur de
H. Monod (1986), C. Durier (1988), O.David (1989?) permet de former
la plus grosse équipe française sur ce thème, équipe qui ne tardera
pas à être reconnue à l'échelon Européen et international.
La mise en place et l'analyse des essais en champs, qui fait l'objet de
collaborations avec le département d'amélioration des plantes , le
GEVES, plusieurs instituts techniques (ITCF, CETIOM...), soulèvent
des problèmes particuliers, liés aux effets terrain, aux effets de
compétition, aussi au grand nombre de variétés souvent prises en compte.
Mes collègues H. Monod et O. David se sont spécialisés la dessus, en
liaison avec mon collègue JB Denis qui se préoccupe plus spécialement
de la modélisation de l'interaction.
La recherche en agro-alimentaire soulève souvent des problèmes liés
au grand nombre de facteurs susceptibles d'intervenir. J'ai pu trouver
des solutions très adaptées à ces problèmes en développant, généralisant
et simplifiant la théorie algébrique des plans d'expériences. Cette
théorie, qui trouve sa source dans les travaux menés juste avant la
première guerre mondiale par F. Yates, R. Fisher, R.C. Bose, a connu une
mutation importante sous l'influence de R. Bailey, une brillante
algébriste qui a longtemps travaillé dans le secteur agronomique,
d'abord à SASS (Scottish Agricultural Service of Statistics à Edimbourgh,
devenu BioSS aujourd'hui), ensuite à ``Rothamsted Experimental Station''.
Mes propres travaux ont largement bénéficié de l'apport de R. Bailey,
mais aussi d'un contact permanent avec les applications.
Les logiciels réalisés sont le fruit de mes recherches, mais sont
aussi à l'origine de plusieurs résultats intéressants. C'est ainsi
qu j'ai trouvé en réalisant PLANOR une méthodologie nouvelle pour
construire des plans ``multistrate'' (le plus connu de ces plans est le
split-plot). Ceci a beaucoup intéressé mon collègue R. Payne, responsable
du logiciel GENSTAT à la station expérimentale de Rothamsted. En s'appuyant
sur PLANOR, mes indications et le texte
Automatic generation of asymetrical regular designs,
il a rajouté
une directive FKEY de construction automatique de plans dans
GENSTAT. Avec PLANOR et les modules aujourd'hui intégrés dans ANALYS,
j'ai construit
une grande partie des tableaux du livre
Les plans factoriels,
par exemple ceux
qui donnent les efficacités factorielles des plans, ou ceux qui
précisent en fonction du nombre
d'unités expérimentales et de la résolution choisie, le nombre de
facteurs à 4 et 2 niveaux qu'il est possible d'introduire dans un
plan régulier. C'est aussi grâce à ces programmes que j'ai découvert que la
notion de résolution IV est essentiellement dépendante de la
paramétrisation et que j'ai pu introduire la bonne paramétrisation pour
analyser le plan utilisé dans la
thèse d'Almena Aliste,
d'où sont issus les papiers sur
le fromage, et
l'utilisation des plans factoriels dans la
fabrication du fromage proposés à J. Dairy
Research, et dont la construction et l'analyse sont explicitées dans
Les plans factoriels.
Très prochainement en ligne...
A coté des axes de recherche que je viens d'évoquer, mes
collaborations, contacts et cours m'ont amenés à réfléchir
et dans certains cas publier sur plusieurs autres sujets:
- Détection de plantes malades
- Le modèle mixte
- Calibration multivariate
- Analyse discriminante
- Intégrateur temps-température
- Absorption du CO2 par les aliments
- Evaluation du risque Listeria Monocytogenes dans un camembert au lait cru
